More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1670 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  40.27 
 
 
313 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  40.62 
 
 
346 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  40.62 
 
 
346 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  40.62 
 
 
346 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 
248 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.62 
 
 
322 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 
248 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.31 
 
 
328 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  50.49 
 
 
593 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  41.74 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  44.93 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  44.6 
 
 
248 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  37.67 
 
 
308 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
242 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  42.61 
 
 
317 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  39.24 
 
 
317 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  39.24 
 
 
318 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  39.24 
 
 
318 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  39.24 
 
 
318 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  39.24 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  36.61 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.63 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  41.34 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  42.03 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 
241 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.33 
 
 
308 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  47.66 
 
 
315 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  38.59 
 
 
314 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  45.07 
 
 
335 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  36.15 
 
 
323 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
241 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  38.64 
 
 
307 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  42.79 
 
 
244 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
241 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  41.55 
 
 
599 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
241 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
583 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 
340 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  38.8 
 
 
312 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 
323 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 
222 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 
248 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 
222 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  45.19 
 
 
318 aa  188  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  47.49 
 
 
588 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  38.68 
 
 
589 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  49.04 
 
 
593 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  34.15 
 
 
311 aa  187  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  45.02 
 
 
510 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  36.33 
 
 
308 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  35.79 
 
 
307 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 
308 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  37.63 
 
 
314 aa  185  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  39.07 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  40 
 
 
579 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  35.96 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
317 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  37.72 
 
 
318 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  35.96 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  37.59 
 
 
325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  44.71 
 
 
582 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  46.5 
 
 
323 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  45.45 
 
 
317 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  48.53 
 
 
283 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 
322 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
578 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
578 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
578 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  43.3 
 
 
253 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  36.73 
 
 
299 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
309 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  46 
 
 
323 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  46.12 
 
 
238 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 
254 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  44.65 
 
 
339 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  39.73 
 
 
590 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  44.29 
 
 
921 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 
310 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  39.66 
 
 
583 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  44.39 
 
 
313 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  43.3 
 
 
253 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
578 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
578 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  41.41 
 
 
585 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  43.3 
 
 
253 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  40.85 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  40.91 
 
 
582 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  38.05 
 
 
312 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 
234 aa  179  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  45 
 
 
326 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  37.46 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.35 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 
578 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  43.58 
 
 
311 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>