More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3253 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  100 
 
 
316 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  93.67 
 
 
316 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  83.49 
 
 
321 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  82.55 
 
 
321 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  82.24 
 
 
321 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  78.33 
 
 
308 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  75.84 
 
 
308 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  77.67 
 
 
308 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  78 
 
 
308 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  77.67 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  77.33 
 
 
308 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  77.18 
 
 
308 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  76 
 
 
310 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  77 
 
 
308 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  75.67 
 
 
310 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  75.17 
 
 
308 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  75.17 
 
 
313 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  76.85 
 
 
336 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  75.17 
 
 
313 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  75.17 
 
 
313 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  76.17 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  76.17 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  76.17 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  63.44 
 
 
334 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  63.39 
 
 
309 aa  381  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  64.14 
 
 
305 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  63.82 
 
 
305 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  64.77 
 
 
298 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  61.96 
 
 
325 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  63.09 
 
 
302 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  63.09 
 
 
297 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  65.03 
 
 
319 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  64.55 
 
 
325 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  62.58 
 
 
319 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  59.74 
 
 
309 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  63.12 
 
 
319 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  60 
 
 
315 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  75.56 
 
 
250 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  75.11 
 
 
239 aa  352  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  60.71 
 
 
343 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  57.53 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  51.01 
 
 
309 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  49.83 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  51.01 
 
 
309 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  49.51 
 
 
336 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  51.32 
 
 
308 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  47.3 
 
 
319 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  48.18 
 
 
321 aa  268  8.999999999999999e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  48.94 
 
 
320 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  48 
 
 
326 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  48.22 
 
 
318 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  49.17 
 
 
307 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  42.91 
 
 
312 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  45.7 
 
 
333 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  45.48 
 
 
319 aa  255  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  46.6 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  45.51 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  43.95 
 
 
309 aa  251  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
355 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 
308 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  43.97 
 
 
329 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  42.72 
 
 
306 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
305 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  42.86 
 
 
318 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  43.59 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  43.46 
 
 
315 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  43.09 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  42.38 
 
 
306 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  42.52 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  43.09 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  43.81 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  44.37 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  44.52 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  43.09 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  43.09 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  42.52 
 
 
308 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 
309 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  42.9 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  42.52 
 
 
319 aa  242  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  43.23 
 
 
308 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  42.68 
 
 
340 aa  242  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  42.17 
 
 
333 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
308 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  42.38 
 
 
306 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.53 
 
 
304 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 
304 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
304 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  43.38 
 
 
306 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.62 
 
 
304 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
316 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  42.38 
 
 
306 aa  235  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  41.67 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  43.13 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  41.12 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  41.67 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>