More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3102 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  66.78 
 
 		 301 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  56.76 
 
 		 741 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  54.3 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  54.3 
 
 		 303 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  53.26 
 
 		 756 aa  298  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  46.53 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6085  ABC transporter related  49.65 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  50.99 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.91 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  39.29 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  42.24 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  43.06 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  42.76 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  40 
 
 		 283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  42.41 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.52 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  45.3 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  40.58 
 
 		 327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  46 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.58 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  42.33 
 
 		 320 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  41.04 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  42.33 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  42.33 
 
 		 326 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  42.33 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  42.33 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  41.55 
 
 		 322 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.62 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  42 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  43.43 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  34.95 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.45 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.58 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  40.26 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  40.69 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  41.2 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.11 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  45.87 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  41.67 
 
 		 344 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  40.4 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  41.22 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.35 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.13 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  42.43 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 351 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 351 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  38.73 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  40.67 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.26 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  39.47 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  42.16 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  36.96 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  41.29 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.63 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.99 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  41.22 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  41.39 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 		 343 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  35.39 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  37.95 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.76 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  39.14 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  38.36 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  40.8 
 
 		 342 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  41.53 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>