More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0274 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  100 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  61.46 
 
 		 302 aa  362  4e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  61.92 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  59.87 
 
 		 306 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  58.78 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  57.62 
 
 		 302 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  53.67 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  55.7 
 
 		 290 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  51.48 
 
 		 330 aa  291  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  49.84 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  56 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  48.68 
 
 		 319 aa  258  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  59.45 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  48.51 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  43.38 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  47.64 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.75 
 
 		 304 aa  234  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  43.42 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  44.52 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  43.79 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  40.06 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  43.89 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.58 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  46.88 
 
 		 374 aa  222  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  43.42 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  43.18 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  43.93 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  47.73 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.1 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  41.58 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  41.08 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  47.95 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  43.05 
 
 		 319 aa  211  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.87 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  40.92 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.35 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  40.92 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  40.92 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  43.11 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.85 
 
 		 741 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  42.31 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  43.45 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  44.09 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  40.13 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.05 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.82 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.71 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  38.17 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  37.42 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  44.91 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  43.02 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  49.06 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 		 339 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.6 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  44.09 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  38.46 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.2 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.97 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  47.57 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.89 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  40.79 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  38 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.3 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  40.46 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  39.87 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.87 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.8 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.1 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>