More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2887 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  100 
 
 		 321 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  99.38 
 
 		 321 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  94.08 
 
 		 321 aa  617  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  83.8 
 
 		 316 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  82.24 
 
 		 316 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  80.53 
 
 		 308 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  80.53 
 
 		 308 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  80.2 
 
 		 308 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  80.53 
 
 		 308 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  79.87 
 
 		 308 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  79.53 
 
 		 308 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  80.87 
 
 		 308 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  78.33 
 
 		 310 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  78 
 
 		 310 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  79.87 
 
 		 308 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  78.86 
 
 		 336 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  78.52 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  78.52 
 
 		 308 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  78.52 
 
 		 308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  78.52 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  78.52 
 
 		 308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  78.52 
 
 		 308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  78.52 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  66.78 
 
 		 298 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  62.71 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  62.95 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  62.75 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  62.82 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  62.62 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  64.17 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  63.33 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  63.52 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  62.9 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  61.07 
 
 		 302 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  61.76 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  75.56 
 
 		 239 aa  358  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  60.06 
 
 		 315 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  59.26 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  74.67 
 
 		 250 aa  355  5.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  58.15 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  57.05 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  57.05 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  50.17 
 
 		 309 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  51.17 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  50.5 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  50.17 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  50.49 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  49.17 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  48.69 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  47.45 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  47.57 
 
 		 321 aa  262  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  47.54 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  47.74 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  47.32 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  46.56 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  44.26 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  48.21 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  44.88 
 
 		 319 aa  251  8.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  43.46 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  43.52 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  42.95 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  43.89 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  42.9 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  43.52 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  43.89 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  43.45 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  43.32 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  41.91 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  44.22 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  44.37 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  43.79 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  42.19 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  41.86 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  42.67 
 
 		 333 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  42.86 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  52.68 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  41.56 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  43 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  41.53 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  41.2 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  40.86 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  42.9 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 306 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  50.47 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  40.79 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  40.98 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  41.25 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  41.45 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  41.35 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  41.25 
 
 		 308 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>