More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4410 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  100 
 
 
307 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  77.23 
 
 
308 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  76.07 
 
 
309 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  74.09 
 
 
314 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  76.57 
 
 
316 aa  477  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  75.91 
 
 
315 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  72.88 
 
 
308 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  72.85 
 
 
308 aa  464  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  73.2 
 
 
308 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  74.1 
 
 
315 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  72.31 
 
 
310 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  72.88 
 
 
329 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  72.37 
 
 
308 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  74.59 
 
 
306 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  72.37 
 
 
309 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  73.6 
 
 
306 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  73.51 
 
 
314 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  73.51 
 
 
316 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  72.85 
 
 
314 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  74.5 
 
 
308 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  70.03 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  70.92 
 
 
314 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  72.52 
 
 
314 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  72.52 
 
 
306 aa  447  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  73.27 
 
 
317 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  72.19 
 
 
314 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  72.04 
 
 
306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  72.28 
 
 
306 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  74.84 
 
 
311 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  71.95 
 
 
306 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  69.74 
 
 
308 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  73.84 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  68.75 
 
 
308 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  70.63 
 
 
306 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  70.03 
 
 
333 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  70.96 
 
 
306 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  69.93 
 
 
318 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  68.42 
 
 
308 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  68.09 
 
 
308 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  67.11 
 
 
308 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  67.55 
 
 
313 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  67.88 
 
 
308 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  67.43 
 
 
319 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  69.28 
 
 
308 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  68.95 
 
 
308 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  63.79 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  62.25 
 
 
308 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63 
 
 
308 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  61.92 
 
 
308 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  63.37 
 
 
310 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  62.46 
 
 
318 aa  381  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  60.98 
 
 
309 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  62.5 
 
 
318 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  49.67 
 
 
309 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  49.34 
 
 
309 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  49.01 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  50.33 
 
 
309 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
310 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  45.1 
 
 
310 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  44.77 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  44.77 
 
 
310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
310 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
308 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  44.88 
 
 
310 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  45.1 
 
 
310 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43.61 
 
 
316 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
310 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  45.16 
 
 
307 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  44.44 
 
 
308 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
308 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
308 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  44.44 
 
 
308 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
308 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
308 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  44.44 
 
 
308 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  45.18 
 
 
326 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
308 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
308 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  42.16 
 
 
304 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 
308 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  43.61 
 
 
298 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  40.58 
 
 
319 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 
305 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  43.67 
 
 
306 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  43 
 
 
308 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  43.42 
 
 
333 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
306 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  43.46 
 
 
321 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  42.35 
 
 
308 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  43.46 
 
 
321 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  42.02 
 
 
308 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 
308 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 
308 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  43.79 
 
 
308 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  45.51 
 
 
308 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 
308 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 
307 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.91 
 
 
310 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  42.67 
 
 
308 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  42.67 
 
 
308 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>