More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0885 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  100 
 
 
309 aa  590  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  98.06 
 
 
309 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  97.41 
 
 
309 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  79.07 
 
 
309 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  53.49 
 
 
336 aa  299  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  50.81 
 
 
308 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  49.24 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  50.48 
 
 
315 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  50.33 
 
 
309 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  51.01 
 
 
316 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  50 
 
 
308 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  50.65 
 
 
314 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  51.16 
 
 
318 aa  285  5.999999999999999e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  50.32 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  51.17 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  51.17 
 
 
321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  50 
 
 
309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  50 
 
 
316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  49.34 
 
 
306 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  50.33 
 
 
333 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  51.17 
 
 
321 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  49.01 
 
 
307 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 
308 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  50.49 
 
 
309 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  49.83 
 
 
310 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 
308 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  53.11 
 
 
310 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  50.33 
 
 
315 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  48.38 
 
 
308 aa  279  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  49.67 
 
 
306 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  49.5 
 
 
310 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  52.9 
 
 
310 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  49.84 
 
 
308 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  50.81 
 
 
305 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  49.84 
 
 
308 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  49.51 
 
 
308 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  49.51 
 
 
308 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  49.67 
 
 
308 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
336 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  50.16 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  47.42 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  49.67 
 
 
314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  48.68 
 
 
306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  49.18 
 
 
308 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  48.03 
 
 
306 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  47.47 
 
 
315 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 
306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  49.01 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  48.21 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  47.71 
 
 
319 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  51.63 
 
 
318 aa  272  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  49.01 
 
 
308 aa  271  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
308 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 
308 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 
308 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  47.04 
 
 
306 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 
308 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  50 
 
 
326 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  50.16 
 
 
305 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  49.01 
 
 
308 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  48.36 
 
 
314 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 
314 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  48.08 
 
 
316 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  46.71 
 
 
308 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  49.01 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  48.03 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  48.03 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  50.33 
 
 
309 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  47.04 
 
 
306 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  48.85 
 
 
308 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  54.94 
 
 
298 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  50.33 
 
 
308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  50.33 
 
 
308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  47.19 
 
 
333 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  48.17 
 
 
308 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  47.9 
 
 
319 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  48.7 
 
 
308 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  50 
 
 
343 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  48.36 
 
 
306 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  48.03 
 
 
308 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.06 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  47.7 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  47.37 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  47.87 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
306 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  47.51 
 
 
306 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  48.38 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  47.7 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  48.21 
 
 
319 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  49.17 
 
 
307 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  46.82 
 
 
325 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  49.34 
 
 
297 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  47.91 
 
 
325 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  54.87 
 
 
250 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  55.36 
 
 
239 aa  262  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  45.28 
 
 
313 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  51.49 
 
 
318 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>