More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0347 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  100 
 
 		 308 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  99.35 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  98.38 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  98.05 
 
 		 308 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  97.73 
 
 		 308 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  97.4 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  97.4 
 
 		 308 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  89.61 
 
 		 313 aa  557  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  89.61 
 
 		 308 aa  557  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  89.61 
 
 		 313 aa  557  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  89.61 
 
 		 313 aa  557  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  90.26 
 
 		 308 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  90.26 
 
 		 336 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  90.26 
 
 		 308 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  88.64 
 
 		 308 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  90.26 
 
 		 308 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  86.77 
 
 		 310 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  86.77 
 
 		 310 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  80.53 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  80.53 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  79.87 
 
 		 321 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  78 
 
 		 316 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  78 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  66.56 
 
 		 298 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  63.28 
 
 		 305 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  63.61 
 
 		 305 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  60.13 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  63.06 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  63.3 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  61.2 
 
 		 297 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  61.31 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  61.78 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  59.94 
 
 		 319 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  75.66 
 
 		 250 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  59.54 
 
 		 309 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  61.76 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  60.26 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  59.37 
 
 		 315 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  75.11 
 
 		 239 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  60.53 
 
 		 343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  56.67 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  52.17 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  50.82 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  50.82 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  49.35 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  49.84 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  50.16 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  47.23 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  48.04 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  47.7 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 		 308 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  47.4 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  46.69 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  46.79 
 
 		 321 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  46.45 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  44.74 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  46.03 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  44.66 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  45.36 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  44.44 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  44.19 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  43.65 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  42.67 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  42.62 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  44.77 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  42.43 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  44.34 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  44.85 
 
 		 309 aa  245  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  43.79 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  42.05 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  41.88 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  41.38 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  42.48 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  43.42 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  43.79 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  50.21 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  42.05 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  41.39 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  42.3 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  43.43 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  43.61 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.48 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  42.11 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  42.11 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  40.13 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  39.61 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  41 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  41 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  41.64 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>