More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0163 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
306 aa  614  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  100 
 
 
306 aa  614  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  55.37 
 
 
309 aa  334  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  57.53 
 
 
316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  57.05 
 
 
316 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  57.33 
 
 
308 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  56.95 
 
 
298 aa  322  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  57 
 
 
308 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  57.33 
 
 
308 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  57.05 
 
 
321 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  56.67 
 
 
308 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  57.05 
 
 
321 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  57.05 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  56.11 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  56.33 
 
 
308 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  55.89 
 
 
302 aa  318  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  56.67 
 
 
308 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  68.49 
 
 
239 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  54.82 
 
 
310 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  53.72 
 
 
319 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  57 
 
 
336 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  54.82 
 
 
310 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
313 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
313 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  56.15 
 
 
308 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  54.28 
 
 
319 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
313 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  56.15 
 
 
308 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  56.15 
 
 
308 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  55.83 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  55.33 
 
 
308 aa  308  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  55.48 
 
 
305 aa  308  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  65.47 
 
 
250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  53.92 
 
 
325 aa  308  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  54.18 
 
 
297 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  53.07 
 
 
319 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  56.03 
 
 
325 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  52.43 
 
 
315 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  52.13 
 
 
309 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  54.2 
 
 
334 aa  292  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 
343 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  50.68 
 
 
326 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  49.83 
 
 
307 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 
309 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 
309 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  49.35 
 
 
308 aa  264  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  48.64 
 
 
336 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  47.51 
 
 
309 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  47.44 
 
 
335 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  48.83 
 
 
321 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  55.02 
 
 
309 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  47.7 
 
 
319 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  44 
 
 
319 aa  252  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  46.1 
 
 
320 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
308 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  46.36 
 
 
333 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.58 
 
 
304 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  45.72 
 
 
310 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  42.43 
 
 
329 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  42.3 
 
 
319 aa  248  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  43.67 
 
 
307 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  47.67 
 
 
318 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  40.66 
 
 
318 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  45 
 
 
308 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  41.67 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  42.14 
 
 
320 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 
314 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  44.67 
 
 
308 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  42.67 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  43.52 
 
 
312 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  44.67 
 
 
308 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  41.64 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
308 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  44.15 
 
 
316 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 
308 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  43.81 
 
 
340 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
308 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
308 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.69 
 
 
304 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
308 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
308 aa  235  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  40.78 
 
 
308 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  42.3 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  43.19 
 
 
318 aa  232  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  38.41 
 
 
312 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  38.41 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  38.41 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  40.33 
 
 
318 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  41.58 
 
 
333 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
309 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  38.41 
 
 
312 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>