More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2923 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  72.85 
 
 		 307 aa  464  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  70.72 
 
 		 308 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  68.75 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  67.87 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  66.99 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  67.11 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  65.79 
 
 		 309 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  66.34 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  66.12 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  67.11 
 
 		 306 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  67.11 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  64.29 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  64.92 
 
 		 329 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  66.78 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  64.17 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  67.11 
 
 		 306 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  65.13 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  66.45 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  65.91 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  66.56 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  65.46 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  62.58 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  65.46 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  67.11 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  63.58 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 		 308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  63.49 
 
 		 314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  62.5 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  64.29 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  63.82 
 
 		 306 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  64.47 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  64.14 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  62.83 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  63.49 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  62.83 
 
 		 316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  62.83 
 
 		 314 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  63.93 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  62.17 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  62.5 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  63.96 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  66.12 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  62.62 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  61.51 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  59.09 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  60.86 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  59.48 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.84 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  59.54 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  59.87 
 
 		 310 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  57.57 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  57.24 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  60.47 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  46.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  47.91 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  45.13 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  43.14 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  42.81 
 
 		 308 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  42.81 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  42.81 
 
 		 308 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.9 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  42.16 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  42.95 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  44.41 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  42.48 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  44.33 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  42.24 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  41.18 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.56 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  42.95 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  43.38 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  43.67 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43 
 
 		 316 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  41.75 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  42.11 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  44.01 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  44.16 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  43.91 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  44.12 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  41.67 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  40.39 
 
 		 308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.14 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  42.81 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>