More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3396 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  485  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  80.82 
 
 		 298 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  74.8 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  75 
 
 		 316 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  74.36 
 
 		 321 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  75.56 
 
 		 321 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  75.56 
 
 		 321 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  75.11 
 
 		 308 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  75.11 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  75.11 
 
 		 316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  73.19 
 
 		 336 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  74.22 
 
 		 308 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  74.67 
 
 		 308 aa  351  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  74.22 
 
 		 308 aa  350  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  73.5 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  73.5 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  73.5 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  72.81 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  72.81 
 
 		 310 aa  347  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  73.78 
 
 		 308 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  72.34 
 
 		 313 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  72.34 
 
 		 313 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  72.34 
 
 		 313 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  72.65 
 
 		 308 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  71.79 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  73.33 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  72.57 
 
 		 305 aa  339  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  73.01 
 
 		 305 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  71.3 
 
 		 297 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  70.94 
 
 		 319 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  67.66 
 
 		 309 aa  334  7e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  71.93 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  71.56 
 
 		 302 aa  329  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  69.1 
 
 		 309 aa  328  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  70.35 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  68.64 
 
 		 319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  70.8 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  69.66 
 
 		 334 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  66.11 
 
 		 315 aa  321  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  67.37 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  68.49 
 
 		 306 aa  314  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  68.49 
 
 		 306 aa  314  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  62.5 
 
 		 308 aa  272  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  57.59 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  55.36 
 
 		 309 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  55.36 
 
 		 309 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  55.36 
 
 		 309 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  52.77 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  55.71 
 
 		 326 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  51.74 
 
 		 335 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  53.42 
 
 		 336 aa  235  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 308 aa  235  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 341 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  54.55 
 
 		 307 aa  234  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  53.92 
 
 		 320 aa  231  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  47.03 
 
 		 312 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 355 aa  230  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  52.51 
 
 		 318 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  49.55 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  50 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  48.71 
 
 		 319 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  50.22 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  50 
 
 		 306 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  50.45 
 
 		 308 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  49.55 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  50.23 
 
 		 307 aa  225  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  49.57 
 
 		 340 aa  225  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  50 
 
 		 319 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  49.1 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  50.88 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  50 
 
 		 319 aa  222  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  51.9 
 
 		 310 aa  221  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  52.94 
 
 		 318 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  48.65 
 
 		 308 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  50 
 
 		 318 aa  221  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  48.65 
 
 		 308 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  49.55 
 
 		 306 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  50.45 
 
 		 309 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  49.77 
 
 		 304 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  50.98 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  51.72 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  48.43 
 
 		 308 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  49.32 
 
 		 319 aa  216  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  50.84 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  49.77 
 
 		 310 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  48.65 
 
 		 309 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  47.3 
 
 		 306 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  46.67 
 
 		 308 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 308 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  49.1 
 
 		 306 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  47.53 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  48.21 
 
 		 310 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  48.65 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  48.88 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  47.75 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  48.2 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>