More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0703 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  100 
 
 		 310 aa  618  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  76.97 
 
 		 308 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  77.3 
 
 		 308 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  76.32 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  72.31 
 
 		 307 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  75.99 
 
 		 308 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  75.99 
 
 		 308 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  73.29 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  72.7 
 
 		 309 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  73.27 
 
 		 306 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  72.17 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  71.9 
 
 		 308 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  71.62 
 
 		 308 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  70.45 
 
 		 329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  72.94 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  71.48 
 
 		 315 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  72.55 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  71.88 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  71.62 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  70.3 
 
 		 306 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  71.38 
 
 		 306 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  69.18 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  71.19 
 
 		 306 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  66.45 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  69.31 
 
 		 306 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  68.32 
 
 		 308 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  69.26 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  68.95 
 
 		 314 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  68.61 
 
 		 314 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  71.85 
 
 		 308 aa  427  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  68.95 
 
 		 314 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  68.28 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  68.63 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  68.95 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  67.1 
 
 		 314 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  68.4 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  65.79 
 
 		 313 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  67 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  64.8 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  65.36 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  63.58 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  70.86 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65 
 
 		 308 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  64.71 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  66.01 
 
 		 311 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  65.46 
 
 		 319 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  64.59 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  65.12 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  64.26 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  64.71 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  63.7 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  61.56 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  62.5 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  53.11 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  51.46 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  48.86 
 
 		 336 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  45.72 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.79 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  44.37 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 336 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  44.74 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  44.74 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  44.05 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  43.75 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  44.74 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.73 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43.04 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  45.72 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  45.51 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.73 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  45.07 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.84 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  44.59 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  43.97 
 
 		 311 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  44.41 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  43.59 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  42.95 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  42.95 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.75 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  44.41 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  44.41 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  42.38 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  44.41 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  43.42 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  43.83 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>