More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0984 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  61.67 
 
 		 298 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  50.64 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  50.5 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  50.96 
 
 		 319 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  50.32 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  51.97 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 343 aa  298  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  51.3 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  50.96 
 
 		 325 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  50.97 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  49.18 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  50.83 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  62.5 
 
 		 239 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  49.17 
 
 		 309 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  50.83 
 
 		 310 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  51.32 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  49.52 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  50.49 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  50.49 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  51.49 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  49.19 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  51.14 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  50.16 
 
 		 308 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  50.16 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 336 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  50.33 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  50.33 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  48.68 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  50.33 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  50.16 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  50.16 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  49.35 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  49.35 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  49.84 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  58.74 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  49.51 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 		 308 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  45.9 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  45.37 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  47.2 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.79 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  45.02 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  45.15 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  46.23 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  48.28 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  45.61 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  45.9 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  44.48 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  45.83 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  44.19 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  41.94 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  41.64 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  42.95 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 355 aa  235  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  42.11 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.96 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  41.31 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  41.31 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 		 314 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  41.1 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  41.18 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  40.51 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  41.31 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  41.31 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.58 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 341 aa  228  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  41.18 
 
 		 317 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  42.44 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  40.07 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  40.2 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  40.45 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  41.88 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  39.61 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  40.92 
 
 		 310 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  42.05 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>