More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0188 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  99.68 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 308 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  99.68 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 308 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  99.68 
 
 		 308 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  94.81 
 
 		 308 aa  597  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  94.81 
 
 		 308 aa  599  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  93.51 
 
 		 308 aa  591  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  84.74 
 
 		 307 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  84.59 
 
 		 310 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  84.39 
 
 		 312 aa  527  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  83.44 
 
 		 307 aa  527  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  82.47 
 
 		 308 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  82.47 
 
 		 308 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  82.72 
 
 		 306 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  82.47 
 
 		 306 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  72.94 
 
 		 305 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  72.82 
 
 		 305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  72.67 
 
 		 305 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  73 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  70.68 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  72.82 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  71.19 
 
 		 310 aa  435  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  71.2 
 
 		 312 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  69.97 
 
 		 313 aa  431  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  69.44 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  71.2 
 
 		 312 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  72.24 
 
 		 326 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  70.87 
 
 		 312 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  70.87 
 
 		 312 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  70.67 
 
 		 319 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  70.59 
 
 		 312 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  70.59 
 
 		 312 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  70.26 
 
 		 312 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  68.98 
 
 		 310 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  68.65 
 
 		 310 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  70.26 
 
 		 312 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  70.2 
 
 		 311 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  67.87 
 
 		 319 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  70.26 
 
 		 312 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  68.87 
 
 		 311 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  64.84 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  65.9 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  67.33 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  67.44 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  67.44 
 
 		 310 aa  411  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  67 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  66.67 
 
 		 310 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  66.56 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  66.67 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  65.13 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  66.67 
 
 		 310 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  66.34 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  64.03 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  65.33 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  61.51 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  68.77 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  62.96 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  63.12 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  62.54 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  60.93 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  60.07 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  60.07 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  60.66 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  59.61 
 
 		 308 aa  362  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  60.26 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  59.87 
 
 		 321 aa  352  5e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  59.93 
 
 		 315 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  58.39 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  55 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 314 aa  271  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  45.6 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  41.78 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  44.34 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  42.95 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  43.37 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  45.25 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  42.57 
 
 		 304 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  43.32 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  42.62 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  43.79 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  42.47 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  43.31 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  42.9 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  43.73 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  43.04 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 262 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  43.27 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>