More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3144 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  100 
 
 
312 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  99.36 
 
 
312 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  97.44 
 
 
312 aa  624  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  97.44 
 
 
312 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  90.38 
 
 
312 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  90.38 
 
 
312 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  90.71 
 
 
312 aa  584  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  90.06 
 
 
312 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  90.06 
 
 
312 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  84.57 
 
 
311 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  83.44 
 
 
311 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  81.7 
 
 
319 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  80.39 
 
 
319 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  78.39 
 
 
313 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  75.15 
 
 
326 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  79.03 
 
 
314 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  72.96 
 
 
310 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  72.76 
 
 
319 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  68.08 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  70.36 
 
 
307 aa  434  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  71.24 
 
 
305 aa  434  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  71.01 
 
 
306 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  70.03 
 
 
305 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  71.24 
 
 
308 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  72.24 
 
 
307 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  70.92 
 
 
308 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  70.59 
 
 
308 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  70.76 
 
 
324 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  70.26 
 
 
308 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  70.59 
 
 
308 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  70.59 
 
 
308 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  67.88 
 
 
310 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  70.59 
 
 
308 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  69.77 
 
 
307 aa  428  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  67.22 
 
 
310 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 
308 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  70.36 
 
 
308 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  66.89 
 
 
310 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  71.24 
 
 
312 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  70.26 
 
 
308 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  70.39 
 
 
310 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  70 
 
 
305 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  66.89 
 
 
310 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  66.89 
 
 
310 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  66.56 
 
 
310 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  69.71 
 
 
306 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  66.56 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  67.33 
 
 
318 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  66.56 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  65.89 
 
 
310 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  65.56 
 
 
307 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  65.35 
 
 
310 aa  407  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  66.11 
 
 
304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  66.23 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  62.54 
 
 
320 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 
304 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  63.79 
 
 
336 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  63.64 
 
 
304 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  63.12 
 
 
316 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  63.97 
 
 
309 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  61.66 
 
 
325 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  61.31 
 
 
320 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  61.33 
 
 
304 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  61.33 
 
 
304 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  60.13 
 
 
309 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  60.13 
 
 
308 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 
308 aa  358  5e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  58.88 
 
 
315 aa  349  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  57.19 
 
 
321 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  58.09 
 
 
315 aa  343  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  58 
 
 
322 aa  335  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 
310 aa  335  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  55.33 
 
 
310 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  57 
 
 
331 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  42.43 
 
 
326 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  43.14 
 
 
333 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  43.37 
 
 
318 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.14 
 
 
335 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  41.23 
 
 
336 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  41.48 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  44.98 
 
 
315 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  44.59 
 
 
318 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  40.66 
 
 
307 aa  242  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  41.85 
 
 
320 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  44.77 
 
 
306 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  43.61 
 
 
310 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  41.8 
 
 
308 aa  238  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  42.26 
 
 
306 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  43.23 
 
 
310 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  43.69 
 
 
319 aa  236  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  42.38 
 
 
308 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  53.18 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>