More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0799 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  100 
 
 		 314 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  49.67 
 
 		 310 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  49.34 
 
 		 310 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  51.67 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  50.99 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  49.01 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  49.01 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  49.03 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  48.34 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  48.85 
 
 		 320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  48.01 
 
 		 310 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  48.51 
 
 		 311 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  48.08 
 
 		 312 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  48 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  48 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  48 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  48 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  49.01 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  47.4 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  49.51 
 
 		 310 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 319 aa  298  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  49.34 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  47.76 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  49.84 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  47.44 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  47.52 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  46.91 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  47.02 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  46.95 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  47.52 
 
 		 315 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  46.25 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  47.85 
 
 		 314 aa  291  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  46.93 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  47.64 
 
 		 319 aa  288  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  49.34 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  45.64 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  45.64 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  45.25 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  47.49 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  47.59 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  48.47 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  47.18 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  47.18 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  47.18 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  48.15 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  48.14 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  49.49 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  48.18 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  48.47 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  43.73 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  48.14 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  45.61 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  45.51 
 
 		 331 aa  259  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  46 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  45.64 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  42.95 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  42.95 
 
 		 310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  42.16 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  47.76 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  42.9 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  43.71 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  43.71 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  41.83 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  43.26 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  46.12 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  40.52 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  40.39 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  39.61 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  42 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  48.97 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  45.56 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>