More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2122 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  66.56 
 
 
310 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  65.46 
 
 
310 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  65.46 
 
 
310 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  65.13 
 
 
310 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  65.13 
 
 
307 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  65.13 
 
 
310 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  65.13 
 
 
310 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  65.46 
 
 
310 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  63.49 
 
 
310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 
310 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  64.8 
 
 
310 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  65.79 
 
 
310 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  63.58 
 
 
319 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  65.23 
 
 
320 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  63.37 
 
 
325 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  63.58 
 
 
336 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  59.02 
 
 
312 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  59.02 
 
 
312 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  59.74 
 
 
314 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  61.18 
 
 
316 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  58.69 
 
 
312 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  61.84 
 
 
307 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  59.93 
 
 
304 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  61.06 
 
 
320 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 
308 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  59.33 
 
 
318 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
310 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  60.54 
 
 
326 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  58.69 
 
 
312 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  59.93 
 
 
304 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 
308 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 
308 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  60.4 
 
 
306 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 
312 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 
308 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  61.11 
 
 
307 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  59.61 
 
 
308 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  59.15 
 
 
309 aa  371  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 
308 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  58.61 
 
 
312 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  58.61 
 
 
312 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 
308 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  59.93 
 
 
308 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  59.93 
 
 
308 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  58.09 
 
 
311 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  59.2 
 
 
319 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  59.8 
 
 
312 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  58.94 
 
 
312 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  61.59 
 
 
308 aa  368  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  58.75 
 
 
311 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  58.28 
 
 
312 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  59.47 
 
 
308 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  58.86 
 
 
313 aa  363  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  58.88 
 
 
310 aa  362  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  58.09 
 
 
304 aa  360  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  57.58 
 
 
309 aa  360  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  57.67 
 
 
304 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  57.67 
 
 
304 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 
306 aa  355  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  58 
 
 
319 aa  351  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  57.57 
 
 
305 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  58.53 
 
 
324 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  58.53 
 
 
305 aa  349  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  57.1 
 
 
321 aa  348  6e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  57.24 
 
 
315 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  57.67 
 
 
307 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 
326 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  56.58 
 
 
315 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  60.61 
 
 
322 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  57.57 
 
 
331 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  56.29 
 
 
305 aa  341  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  57.05 
 
 
310 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  57.05 
 
 
310 aa  338  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
314 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  46.73 
 
 
308 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  46.73 
 
 
308 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  45.42 
 
 
308 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  46.73 
 
 
318 aa  261  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  47.21 
 
 
319 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  45.7 
 
 
336 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  44.41 
 
 
307 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.43 
 
 
326 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  43.77 
 
 
319 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  47.37 
 
 
318 aa  255  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  43.69 
 
 
319 aa  254  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  45.25 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  56.7 
 
 
262 aa  252  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  44.66 
 
 
309 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  44.79 
 
 
335 aa  251  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  45.07 
 
 
333 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  45.21 
 
 
320 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  41.88 
 
 
306 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>