More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2744 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  100 
 
 		 309 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  63.09 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  62.12 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  63.39 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  62.71 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  62.37 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  62.37 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  62.08 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  62.71 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  60.47 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  60.47 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  60.13 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  61.49 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  61.54 
 
 		 310 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  60.13 
 
 		 308 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  60.47 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  59.8 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  60.14 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  60.14 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  60.14 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 		 308 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 		 313 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 		 313 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 		 313 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  58.8 
 
 		 308 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  60.14 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  58.86 
 
 		 308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  57.98 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  59.47 
 
 		 325 aa  352  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  57.1 
 
 		 305 aa  349  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  57.43 
 
 		 319 aa  348  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  56.77 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  72.27 
 
 		 250 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  56.57 
 
 		 309 aa  338  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  54.43 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  55.37 
 
 		 306 aa  334  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 306 aa  334  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  67.66 
 
 		 239 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  54.43 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 343 aa  332  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  54.69 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  54.07 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  49.17 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  45.9 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  46.73 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  45.22 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  45.33 
 
 		 309 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  45.79 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  44.78 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  42.95 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 308 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 308 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  44.77 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  43.87 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43.45 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.88 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  41.25 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  43.42 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  42.11 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.28 
 
 		 335 aa  241  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.45 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  43.14 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  43.81 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  42 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  40.85 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  41.78 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  40.13 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  41.12 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  41.2 
 
 		 308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  41.14 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  41.12 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  40.45 
 
 		 310 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  40.86 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  41.12 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  42.14 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 326 aa  231  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  40.13 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  40.79 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  38.89 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>