More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0096 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  100 
 
 		 312 aa  630  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  42.12 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  44.26 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  44.26 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  43.89 
 
 		 305 aa  255  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  43.56 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  44.03 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  45.64 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  44.48 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  44.66 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  45.3 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  44.97 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  44.97 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  44.97 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  42.26 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.42 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  43.71 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  42.57 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  44.37 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.23 
 
 		 326 aa  245  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  45.22 
 
 		 309 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  44.52 
 
 		 319 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  44.3 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  42.71 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  41.25 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  43.75 
 
 		 336 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  44.3 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  43.54 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  41.67 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  40.92 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  40.58 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  41.5 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  42.42 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  43.41 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  43.52 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  46.2 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 309 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  42.57 
 
 		 298 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  43.09 
 
 		 321 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  41.31 
 
 		 309 aa  238  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  42.57 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  40.73 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  43.61 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  40.26 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  41.31 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  41.31 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  41.2 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  42.05 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  40.78 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  40.97 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  39.87 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  41.31 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  40.59 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  40.73 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  39.94 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  39.29 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  41.39 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  47.09 
 
 		 250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  40.63 
 
 		 316 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  41.03 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  41.37 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  47.03 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  40.43 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  40.26 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  41.03 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  38.51 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.09 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  41.1 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  42.38 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  39.13 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  41.37 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  41.03 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  41.06 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  38.96 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  40.51 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  41.25 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.41 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  41.69 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  40.47 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  41.64 
 
 		 308 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  41 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>