More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3283 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  81.37 
 
 		 306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  80.66 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  79.02 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  79.41 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  79.08 
 
 		 306 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  76.39 
 
 		 306 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  73.6 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  73.27 
 
 		 310 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  72.55 
 
 		 308 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  71.15 
 
 		 308 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  70.49 
 
 		 308 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  71.24 
 
 		 308 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  71.15 
 
 		 308 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  71.15 
 
 		 308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  70.82 
 
 		 308 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  71.8 
 
 		 315 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  68.75 
 
 		 318 aa  434  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  70.59 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  70.39 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  69.28 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  69.84 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  69.18 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  69.28 
 
 		 308 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  69.93 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  66.89 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  68.52 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  68.75 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  68.42 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  68.75 
 
 		 314 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  68.09 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  67.76 
 
 		 316 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  67.76 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  67.76 
 
 		 314 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  65.03 
 
 		 313 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  67.19 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  69.93 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  66.45 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  67.87 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  65.79 
 
 		 314 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  66.78 
 
 		 306 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  67.32 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  67.11 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  66.99 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  68.75 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  63.73 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  61.51 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.39 
 
 		 308 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  63.79 
 
 		 318 aa  387  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  63.4 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  63.82 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  64.12 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  61.18 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  48.68 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.36 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  44.37 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  43.85 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  44.52 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  44.08 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  43.04 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  43.42 
 
 		 308 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.19 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  43.42 
 
 		 308 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  43.42 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  44.48 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  43.97 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  42.35 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  42.12 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  41.91 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  42.02 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  42.76 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  41.75 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  43.09 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  40.13 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  42.9 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  41.69 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  41.39 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  42.9 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  42.04 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  42.9 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  42.72 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  41.5 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  40.84 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  41.88 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  41.2 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>