More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2361 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 306 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  88.52 
 
 		 306 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  80.66 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  78.36 
 
 		 306 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  76.8 
 
 		 306 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  77.05 
 
 		 306 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  77.38 
 
 		 306 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  72.22 
 
 		 333 aa  454  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  72.13 
 
 		 308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  71.48 
 
 		 308 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  71.1 
 
 		 318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  71.8 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  72.52 
 
 		 307 aa  447  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  70.82 
 
 		 308 aa  447  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  71.15 
 
 		 308 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  71.48 
 
 		 308 aa  447  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  70.16 
 
 		 308 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  70.16 
 
 		 308 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 		 314 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  69.74 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  69.84 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  68.2 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  71.19 
 
 		 310 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  68.52 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  70.49 
 
 		 308 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  68.2 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  68.42 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  69.74 
 
 		 319 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  67.11 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  68.09 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  66.56 
 
 		 340 aa  417  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  67.43 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  67.43 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  67.11 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  67.53 
 
 		 329 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  67.11 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  67.11 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  66.45 
 
 		 314 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  64.38 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  66.56 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  68.75 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  67.65 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  66.12 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  65.79 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  65.79 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  64.8 
 
 		 306 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  62.62 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  62.3 
 
 		 308 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  64.03 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  64.8 
 
 		 318 aa  387  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.4 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  61.84 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  60.2 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 		 309 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.03 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  49.01 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  44.22 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  43.85 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.3 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43.14 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  41.31 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  44.81 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  44.16 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  44.66 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.29 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  44.19 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  43.32 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  42.11 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  41.91 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  43 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  41.45 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  42.16 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  41.78 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  41.86 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  42.76 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 308 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  42.95 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  42.16 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.66 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  43.32 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  43.14 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  42.48 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  42.07 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  42.16 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  41.85 
 
 		 310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  42.38 
 
 		 316 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  42.19 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 		 307 aa  235  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>