More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2014 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  100 
 
 		 309 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  64.71 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  62.5 
 
 		 308 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  62.83 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  61.64 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  61.56 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  62.46 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  62.09 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  62.42 
 
 		 319 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  61.36 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  60.98 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  61.44 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  62.17 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  61.44 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  59.54 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  60.53 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  61.44 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  61.18 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  61.51 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  58.63 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  60.78 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  58.55 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  63.31 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  58.69 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  60.13 
 
 		 309 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  58.63 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  61.64 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  63.49 
 
 		 318 aa  364  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  60.2 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  61.18 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  60.33 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  60.46 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  59.8 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.07 
 
 		 308 aa  362  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  60.2 
 
 		 306 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  58.88 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  59.48 
 
 		 314 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  59.8 
 
 		 314 aa  361  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  61.11 
 
 		 318 aa  361  9e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  59.48 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  59.48 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  59.48 
 
 		 316 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  59.8 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  58.88 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  57.52 
 
 		 306 aa  358  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  59.54 
 
 		 308 aa  358  8e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  59.28 
 
 		 317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  58.8 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  59.01 
 
 		 340 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  59.61 
 
 		 333 aa  352  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  58.5 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  59.42 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  52.92 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  50.33 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  50.66 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  50.33 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  45.51 
 
 		 319 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  45.31 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  45.03 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  44.22 
 
 		 336 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  44.52 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  44.98 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  44.82 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  44.85 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  44.85 
 
 		 308 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.04 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  43.04 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  44.52 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.45 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  44.85 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.04 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  44.52 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  42.26 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  43.69 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  44.55 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  44.48 
 
 		 307 aa  241  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  44.21 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  44.55 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  43.51 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  44.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  43.51 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  43.09 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  42.67 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  44.52 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  42.35 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  42.45 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  44.22 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  44.19 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  44.52 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  44.06 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  43.69 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  42.57 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  41.99 
 
 		 319 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>