More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3261 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  100 
 
 		 317 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  99.37 
 
 		 316 aa  634    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  99.05 
 
 		 314 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  97.14 
 
 		 314 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  96.19 
 
 		 314 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  95.56 
 
 		 314 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  93.02 
 
 		 314 aa  591  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  74.28 
 
 		 315 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  71.66 
 
 		 308 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  73.29 
 
 		 309 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  73.11 
 
 		 308 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  73.27 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  72.13 
 
 		 308 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  70.36 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  69.48 
 
 		 308 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  67.54 
 
 		 308 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  70.59 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  69.03 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  70.82 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  66.78 
 
 		 313 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  68.22 
 
 		 340 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  68.2 
 
 		 306 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  68.2 
 
 		 306 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  66.45 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  68.52 
 
 		 306 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  68.4 
 
 		 310 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  66.88 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  66.88 
 
 		 308 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  68.85 
 
 		 306 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  66.56 
 
 		 308 aa  417  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  68.18 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  67.87 
 
 		 306 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  66.56 
 
 		 306 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  66.56 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  67.21 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  66.89 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  69.38 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  66.89 
 
 		 315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  64.72 
 
 		 308 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  64.19 
 
 		 314 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  65.25 
 
 		 308 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  64.72 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  65.81 
 
 		 311 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  64.26 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  61.81 
 
 		 308 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  63.93 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  61.49 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  63.25 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.17 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  60.98 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  61.51 
 
 		 318 aa  358  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  59.28 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  47.87 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  47.87 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  47.59 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  42.21 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43.51 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  44.33 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.3 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  43.73 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  42.99 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.3 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 310 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  42.76 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 310 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  45.33 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.67 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  42.68 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  43.4 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  41.53 
 
 		 319 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  42.37 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  43.42 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  43.45 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  43.32 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  41.69 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  40.51 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  42.16 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  42.02 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  42.5 
 
 		 310 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  41.83 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>