More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3671 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  99.03 
 
 
308 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  99.03 
 
 
313 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  99.03 
 
 
313 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  99.03 
 
 
313 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  98.05 
 
 
336 aa  607  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  90.58 
 
 
308 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  90.26 
 
 
308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  89.94 
 
 
308 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  90.26 
 
 
308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  90.26 
 
 
308 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  89.61 
 
 
308 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  88.96 
 
 
308 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  85.81 
 
 
310 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  85.06 
 
 
308 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  85.16 
 
 
310 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  78.86 
 
 
321 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  78.86 
 
 
321 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  78.86 
 
 
321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  76.17 
 
 
316 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  75.84 
 
 
316 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  66.56 
 
 
298 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  64.57 
 
 
305 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  63.91 
 
 
305 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  62.15 
 
 
334 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  61.2 
 
 
319 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  60.14 
 
 
309 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  62.5 
 
 
325 aa  364  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  60.54 
 
 
297 aa  362  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 
325 aa  362  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  75.22 
 
 
250 aa  358  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  61.84 
 
 
319 aa  358  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  60.45 
 
 
319 aa  358  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  59.74 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  62.25 
 
 
343 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  60.98 
 
 
302 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  73.5 
 
 
239 aa  351  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  57.19 
 
 
315 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  56.48 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  56.48 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  50.66 
 
 
336 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  51.34 
 
 
309 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  50.33 
 
 
309 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  46.82 
 
 
309 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  48.48 
 
 
326 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 
309 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  50.33 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  48.03 
 
 
320 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  46.89 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  47.59 
 
 
321 aa  262  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  45.79 
 
 
307 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
308 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  45.13 
 
 
319 aa  255  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  45.71 
 
 
335 aa  255  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  45.78 
 
 
318 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  45.72 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  42.39 
 
 
318 aa  248  7e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  44.41 
 
 
310 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  43.51 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  42.68 
 
 
309 aa  245  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  43.75 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  44.12 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  43.43 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
314 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  43.09 
 
 
306 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  52.7 
 
 
309 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  44.04 
 
 
308 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  42.48 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  42.76 
 
 
306 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  41.78 
 
 
306 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  43.38 
 
 
308 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  43.38 
 
 
306 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  42.38 
 
 
306 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  42.38 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  42.24 
 
 
308 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  43.73 
 
 
318 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
316 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  43.04 
 
 
333 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  43.55 
 
 
318 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  42.62 
 
 
306 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  40.91 
 
 
319 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  41.4 
 
 
308 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  42.05 
 
 
315 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  41.61 
 
 
314 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  41.72 
 
 
306 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  41.59 
 
 
308 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
308 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  41.61 
 
 
316 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  41.59 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  43 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  41.31 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  39.09 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  42.86 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
341 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  41.39 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  41.67 
 
 
315 aa  232  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  41.29 
 
 
314 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>