More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2525 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  71.05 
 
 		 310 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  69.41 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  69.74 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  69.08 
 
 		 308 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  66.78 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  66.78 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  66.12 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  65.13 
 
 		 306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  65.46 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  65.79 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  64.47 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  67.76 
 
 		 318 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  63.79 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  65.79 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  64.14 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  63.61 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  64.47 
 
 		 315 aa  394  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  64.47 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  63.82 
 
 		 314 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  64.14 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  64.71 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  62.17 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  64.17 
 
 		 308 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  63.49 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  64.17 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  64.14 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  64.14 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 309 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  61.84 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  64.47 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  62.87 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  62.62 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  63.93 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  63.16 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  61.84 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  60.56 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  63.82 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  62.71 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  61.56 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  62.46 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  59.48 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  60.78 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  61.18 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  61.44 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  60.86 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  60.33 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  59.67 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  60.65 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.31 
 
 		 308 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  60.53 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  61.18 
 
 		 308 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  52.77 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  50.49 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  50.49 
 
 		 309 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.81 
 
 		 326 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  42.48 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  43.09 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  43.79 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.59 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  43.59 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  43.61 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  42.45 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  44.41 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  42.81 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.29 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  42.48 
 
 		 305 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  43.28 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  42.32 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  42.67 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  43.32 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  41.12 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  42.53 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  42.86 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  43.32 
 
 		 321 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  41.38 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  42.01 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 		 310 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  41.38 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  42.02 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  41.07 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  41.56 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>