More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2740 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  88.52 
 
 
306 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  81.37 
 
 
306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  80 
 
 
306 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  77.7 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  77.12 
 
 
306 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  77.78 
 
 
306 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  74.1 
 
 
308 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  74.51 
 
 
308 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  74.18 
 
 
308 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  74.59 
 
 
307 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  73.44 
 
 
315 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  71.48 
 
 
308 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  71.48 
 
 
333 aa  448  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  71.38 
 
 
318 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  72.94 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  70.92 
 
 
308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  70.49 
 
 
308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  71.71 
 
 
309 aa  441  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  69.28 
 
 
308 aa  437  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  69.51 
 
 
308 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  70.16 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  69.51 
 
 
308 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  71.9 
 
 
308 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  69.18 
 
 
308 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  69.74 
 
 
316 aa  431  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  70.07 
 
 
314 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  70.39 
 
 
314 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  70.39 
 
 
314 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 
314 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  69.51 
 
 
315 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  70.07 
 
 
314 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  69.74 
 
 
314 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  69.41 
 
 
319 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  69.41 
 
 
316 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  67.11 
 
 
308 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  68.63 
 
 
308 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  68.51 
 
 
329 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  67.51 
 
 
340 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  68.85 
 
 
317 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  67.43 
 
 
306 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  68.95 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  65.03 
 
 
313 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  68.95 
 
 
308 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  69.08 
 
 
311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  65.79 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  63.4 
 
 
308 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  63.07 
 
 
308 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  63.7 
 
 
318 aa  387  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.4 
 
 
308 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  61.84 
 
 
310 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  62.5 
 
 
318 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  60.2 
 
 
309 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  50.33 
 
 
309 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 
309 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 
309 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.03 
 
 
309 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  45.48 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  45.03 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  42.11 
 
 
319 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.3 
 
 
307 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  43.32 
 
 
305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  43 
 
 
310 aa  244  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.19 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  42.48 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  42.38 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 
310 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  44.66 
 
 
310 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  42.43 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
336 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  42.67 
 
 
305 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  42.05 
 
 
308 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  42.43 
 
 
308 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.51 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  42.35 
 
 
312 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  43.55 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  41.86 
 
 
308 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  41.86 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  41.72 
 
 
308 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  39.87 
 
 
304 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.69 
 
 
310 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 
304 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
304 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 
336 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  41.97 
 
 
297 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  42.81 
 
 
310 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  41.42 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  42.81 
 
 
310 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  41.42 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  42.35 
 
 
307 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  42.11 
 
 
308 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  42.95 
 
 
310 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  41.69 
 
 
308 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 
308 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 
324 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  40.79 
 
 
320 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>