More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6045 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  96.1 
 
 
308 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  80.58 
 
 
315 aa  510  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  73.62 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  72.88 
 
 
307 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  74.18 
 
 
306 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  72.79 
 
 
308 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  73.03 
 
 
314 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  72.7 
 
 
316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  73.03 
 
 
314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  71.15 
 
 
306 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  72.7 
 
 
314 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  72.04 
 
 
314 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  71.24 
 
 
306 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  70.82 
 
 
306 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  73.05 
 
 
308 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  72.37 
 
 
314 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  71.62 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  71.57 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  71.48 
 
 
306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  72.13 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  69.71 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  70.49 
 
 
308 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  68.77 
 
 
340 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  70.49 
 
 
306 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  70.49 
 
 
306 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  69.51 
 
 
308 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  68.95 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  67.21 
 
 
308 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  68.2 
 
 
308 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  68.52 
 
 
308 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  68.73 
 
 
333 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  67.21 
 
 
315 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  67.65 
 
 
314 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  66.34 
 
 
308 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  67.54 
 
 
309 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  66.88 
 
 
308 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  66.56 
 
 
316 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  66.12 
 
 
319 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  65.13 
 
 
306 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  68.09 
 
 
308 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  64.26 
 
 
313 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  64.8 
 
 
308 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  65.46 
 
 
308 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  64.59 
 
 
311 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.84 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  62.34 
 
 
308 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  62.01 
 
 
308 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  64.17 
 
 
309 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  62.14 
 
 
318 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  61.39 
 
 
318 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  61.51 
 
 
310 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  58.88 
 
 
309 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  50.81 
 
 
309 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 
309 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  50 
 
 
309 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.85 
 
 
326 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  44.08 
 
 
333 aa  251  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  44.82 
 
 
336 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  41.94 
 
 
319 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.1 
 
 
304 aa  248  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.69 
 
 
307 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43.04 
 
 
316 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  42.62 
 
 
308 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  42.3 
 
 
308 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  42.57 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  41.97 
 
 
308 aa  245  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  42.3 
 
 
308 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  42.16 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  42.43 
 
 
318 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  42.52 
 
 
316 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  42.19 
 
 
321 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  42.19 
 
 
321 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
325 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.73 
 
 
310 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  41.97 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  43.46 
 
 
310 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  40.46 
 
 
310 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  41.2 
 
 
316 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  40.26 
 
 
312 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  41.99 
 
 
308 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 
308 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  42.17 
 
 
297 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  43.75 
 
 
308 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 
310 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  40.91 
 
 
308 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  41.39 
 
 
307 aa  234  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  40.91 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  42.58 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  40.45 
 
 
319 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  40.78 
 
 
305 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  42.72 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 
310 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  42.26 
 
 
310 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  42.26 
 
 
310 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>