More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3274 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  99.68 
 
 		 308 aa  607  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  70.36 
 
 		 310 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  68.18 
 
 		 308 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  69.74 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  64.29 
 
 		 308 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  64.71 
 
 		 308 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  65.25 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  63.16 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  68.54 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  63.93 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  64.26 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  64.59 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  63.93 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  62.34 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  62.62 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  63.93 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  62.66 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  63.93 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  63.4 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  63.4 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  62.34 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  63.61 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  62.34 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  63.07 
 
 		 315 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  62.01 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  62.17 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  63.73 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  62.3 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  62.01 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  62.25 
 
 		 307 aa  391  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  61.44 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  62.09 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3261  ABC transporter related  61.81 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  61.04 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  60 
 
 		 316 aa  384  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  62.83 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  62.42 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  62.38 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1927  ABC transporter-related protein  62.34 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.06 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  61.64 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  61.36 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  58.77 
 
 		 309 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  56.03 
 
 		 313 aa  374  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  60.2 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  59.62 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  57.57 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  60.33 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  57.05 
 
 		 306 aa  364  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  57.19 
 
 		 308 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  50.33 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.38 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.7 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  46.33 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.38 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  43.23 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.14 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  43.14 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  42.16 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.14 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  44.26 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  42.21 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.18 
 
 		 310 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  43.61 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  43.14 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  43.51 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  42.02 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  42.43 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  39.94 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  42.86 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 		 319 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  41.37 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  41.45 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  41.5 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  41.25 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  41.04 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  42.26 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  41.78 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  42.26 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  41.29 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  41.53 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.37 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  41.37 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>