More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3909 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 319 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  84.69 
 
 		 326 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  86.41 
 
 		 314 aa  550  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  83.77 
 
 		 313 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  80.72 
 
 		 312 aa  517  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  81.05 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  80.72 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  80.39 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  80.72 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  81.37 
 
 		 319 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  80.39 
 
 		 312 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  80.39 
 
 		 312 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  80.07 
 
 		 312 aa  507  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  78.57 
 
 		 311 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  78.46 
 
 		 311 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  79.41 
 
 		 312 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 310 aa  458  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  70.97 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  69.44 
 
 		 310 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  70.96 
 
 		 305 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  69.21 
 
 		 307 aa  431  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  72.15 
 
 		 307 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  68.44 
 
 		 310 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  69.1 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  69.77 
 
 		 306 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  70.53 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  69.61 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  68.44 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  66.99 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  70.07 
 
 		 324 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  68.11 
 
 		 310 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  69.8 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  69.54 
 
 		 305 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  70.67 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  71.14 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  70.67 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  71.14 
 
 		 308 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  70.67 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  70.67 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  71.81 
 
 		 312 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  67.44 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  70.81 
 
 		 310 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  67.77 
 
 		 310 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  70.81 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  70.33 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  67.77 
 
 		 310 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  68.52 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  66.78 
 
 		 310 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  67.77 
 
 		 310 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  69.1 
 
 		 310 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  65.56 
 
 		 307 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  63.91 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  63.91 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  63.34 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  65.33 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  64.36 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  60.38 
 
 		 320 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  61.64 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  62.63 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  62.63 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  60.2 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  61.2 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  58.88 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  59.6 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  59.6 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  59.2 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  59.8 
 
 		 315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  58.5 
 
 		 315 aa  352  7e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  57.24 
 
 		 322 aa  340  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  54.87 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  55.03 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  54.7 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  41.8 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  42.47 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  44.01 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  42.11 
 
 		 307 aa  245  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  43.79 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  44.95 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  41.37 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  42.76 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  42.48 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  42.9 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  42.05 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  42.43 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.34 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  42.62 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  40.45 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  42.12 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  42.11 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>