More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4185 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  100 
 
 		 320 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  65.5 
 
 		 319 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  63.25 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  63.49 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  58.22 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  58.41 
 
 		 336 aa  358  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  59.41 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  60.07 
 
 		 319 aa  353  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  56.77 
 
 		 307 aa  338  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  56.45 
 
 		 335 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  47.21 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  49.19 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  48.69 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  48.69 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  46.45 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  48.69 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  48.69 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  44.94 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  48.94 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  48.03 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  50 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  47.02 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 		 336 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  48.04 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  47.71 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  47.23 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  47.87 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  47.39 
 
 		 308 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  47.57 
 
 		 308 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  46.69 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  45.22 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 		 343 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  45.14 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  47.06 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  44.27 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  45.13 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  46.84 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  44.01 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  42.72 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  44.41 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  45.02 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  45.64 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  45.25 
 
 		 304 aa  252  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  46.1 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  42.72 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  45.26 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  42.44 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  41.21 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.82 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  44.44 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  42.11 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  45.52 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  42.76 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  44.17 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  44.52 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  43.46 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  45.61 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.82 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  43.56 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  43.13 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  43.82 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  43.09 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  42.43 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  42.3 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  41.53 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  41.19 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  42.9 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  41.85 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  41.88 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  41.45 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  41.45 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  40.46 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  40.46 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  41.45 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  42.9 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  41.45 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  41.53 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  41.78 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  40.79 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  41.45 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 308 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.77 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>