More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2288 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  44.77 
 
 		 326 aa  255  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  45.25 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  45.89 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  44 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 308 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 308 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  43 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  44.08 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  48.41 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  41.75 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.69 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  43.88 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  43.79 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  42.24 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  46.39 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  46.39 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  42.86 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  40.45 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  46.2 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  44.37 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  43.4 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.67 
 
 		 310 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  44.83 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  43.56 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  44.33 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  51.56 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  43.69 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  42.47 
 
 		 310 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  42.9 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  43 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  43.48 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  45.36 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  43.23 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  40.92 
 
 		 310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  40.84 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  50 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  43.81 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.39 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  39.48 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  43.81 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  43.14 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  41.58 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  42.23 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  42.31 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  41.4 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  40 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  41.08 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  41.9 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  47.83 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  39.22 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 336 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  43 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  39.74 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  43.86 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  41.78 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  43.14 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  40 
 
 		 310 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  43.23 
 
 		 320 aa  231  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  39.41 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  39.41 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  43.91 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  42.9 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  40.26 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  39.68 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  39.31 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  39.07 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  43 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  43.14 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  44.33 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>