More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1855 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  100 
 
 		 319 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  67.09 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  65.57 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  59.55 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  60.07 
 
 		 320 aa  353  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  58.96 
 
 		 319 aa  352  5.9999999999999994e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  59.28 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  54.46 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  54.58 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  51.4 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 		 316 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  47.45 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  47.45 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  46.84 
 
 		 316 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  44.81 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  46.86 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  44.3 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.16 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  46.73 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  45.6 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  45.54 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  45.54 
 
 		 305 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  46.41 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  46.45 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  43.97 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  45.48 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  46.45 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  44.48 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  43.99 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  45.11 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  47.7 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  48.6 
 
 		 309 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  45.75 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  43.79 
 
 		 305 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 		 343 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  43.35 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  43.83 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  44.9 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  46.83 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  42.57 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  43.79 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.73 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  43.42 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  43.97 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  41.8 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  42.95 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  45.6 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 		 307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  42.36 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  43.59 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 319 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  42.62 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  44.13 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  44.69 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  43.37 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  42.95 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  43.65 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  44.13 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  41.88 
 
 		 312 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  41.56 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  44.37 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  41.56 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  41.56 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 262 aa  235  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  45.15 
 
 		 308 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.62 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  45.1 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  41.97 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  41.78 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  41.29 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  41.9 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  50.87 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  43.46 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  43.03 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>