More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02791 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 331 aa  673    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  87.22 
 
 		 322 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  80.58 
 
 		 310 aa  518  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  80.52 
 
 		 310 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 318 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  57.05 
 
 		 319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  57.1 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  60.07 
 
 		 307 aa  350  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  57.98 
 
 		 319 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  58 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  56.31 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  57.53 
 
 		 308 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  57.1 
 
 		 310 aa  342  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  56.82 
 
 		 310 aa  342  7e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  55.84 
 
 		 314 aa  341  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  57.67 
 
 		 310 aa  341  9e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  56.31 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  56.31 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  55.81 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  56.51 
 
 		 336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  57.05 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  57.05 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  56.03 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  56.03 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  56.03 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  56.03 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 308 aa  338  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  57.62 
 
 		 307 aa  338  8e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  55.66 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  58.39 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  54.23 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  55.7 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  56.95 
 
 		 306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  55.81 
 
 		 312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  56.35 
 
 		 312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  55.66 
 
 		 312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  56.03 
 
 		 312 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 		 312 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  55.34 
 
 		 312 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  58.33 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  56.03 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  56.67 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  56.03 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  57.57 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  53.29 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  53.33 
 
 		 304 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 307 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  55.34 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  55.45 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 		 304 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  53.29 
 
 		 304 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  55.45 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  56.13 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  55.37 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.79 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 		 305 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  55.48 
 
 		 320 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  54.43 
 
 		 316 aa  328  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  53.4 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  55.15 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  53.97 
 
 		 304 aa  318  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  53.97 
 
 		 304 aa  318  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  55.15 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  53.25 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  55.05 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.04 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  42.63 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  45.51 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  43.33 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  43.75 
 
 		 306 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  43.55 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  42.95 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  42.67 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  41.96 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  41.75 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  42.58 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  43.14 
 
 		 306 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  42.16 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  42.62 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  43.46 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.59 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  42.95 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  42.53 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>