More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3107 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  100 
 
 
323 aa  618  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  61.33 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  55.92 
 
 
302 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  56.67 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  56.33 
 
 
302 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  55.18 
 
 
322 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  54.71 
 
 
331 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  55.18 
 
 
299 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  53.85 
 
 
330 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  54.67 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  53.64 
 
 
290 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
308 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  51.09 
 
 
256 aa  235  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.12 
 
 
304 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  48.46 
 
 
374 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  46.28 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  45.9 
 
 
309 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  44.59 
 
 
319 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.98 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  44.66 
 
 
310 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  44.66 
 
 
310 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
310 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  44.34 
 
 
310 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
300 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
302 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  46.53 
 
 
312 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  48.33 
 
 
302 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  41.93 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  44.41 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
313 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.86 
 
 
304 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
313 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 
309 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 
305 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
305 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.12 
 
 
308 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  42.53 
 
 
315 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  46.08 
 
 
308 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  45.3 
 
 
301 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
338 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  43.37 
 
 
319 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  47.41 
 
 
290 aa  202  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  42.67 
 
 
741 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  44.64 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.92 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  49.52 
 
 
301 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  44.08 
 
 
300 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
301 aa  199  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  40.72 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.84 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  45.64 
 
 
282 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
333 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
301 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  43.46 
 
 
756 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  46.76 
 
 
263 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  46.03 
 
 
334 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
310 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  42.3 
 
 
314 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  37.83 
 
 
311 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.21 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.84 
 
 
339 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  40 
 
 
317 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  34.88 
 
 
305 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
299 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  40.4 
 
 
308 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  38.24 
 
 
305 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  40.46 
 
 
303 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
293 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  40 
 
 
254 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
300 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  39.42 
 
 
319 aa  185  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
297 aa  185  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  39.48 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  34.55 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  35.25 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
312 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.2 
 
 
326 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.86 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 
300 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  41.08 
 
 
323 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.39 
 
 
316 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
300 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 
300 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  37.75 
 
 
333 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.42 
 
 
319 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  42.05 
 
 
303 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
314 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
309 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.79 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  40.59 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.66 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>