More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2380 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  100 
 
 		 338 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  70.49 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  71 
 
 		 310 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  71 
 
 		 310 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  71 
 
 		 310 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  70.82 
 
 		 319 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  73.18 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  66.56 
 
 		 312 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  66.12 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  65.8 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  58.6 
 
 		 388 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  63.31 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  61.18 
 
 		 308 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  63.34 
 
 		 374 aa  345  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 		 302 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  62.05 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  55.15 
 
 		 314 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  59.94 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  58.82 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.07 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  53.62 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  57.1 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  52.6 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  47.35 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  48.43 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  46.86 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  44.52 
 
 		 306 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  44.48 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  45.11 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  46.64 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 302 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.19 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  44.44 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 301 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.39 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.99 
 
 		 304 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  40.8 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.64 
 
 		 284 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  37.17 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.88 
 
 		 283 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.39 
 
 		 313 aa  196  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.46 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  42.67 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  46.12 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.26 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  42.47 
 
 		 284 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 280 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.53 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 302 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  40.72 
 
 		 256 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  47.27 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.67 
 
 		 254 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  46.72 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  50 
 
 		 317 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.31 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.32 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.14 
 
 		 294 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.47 
 
 		 300 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  34.98 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.14 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.84 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  40 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.29 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.55 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  38.84 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  44.55 
 
 		 263 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  46.19 
 
 		 289 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.88 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.61 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.69 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>