More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2965 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  100 
 
 
313 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  70.29 
 
 
309 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  70.97 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  66.99 
 
 
302 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  66.99 
 
 
308 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.95 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  62.7 
 
 
312 aa  353  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  62.13 
 
 
388 aa  335  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  59.94 
 
 
338 aa  331  9e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  56.73 
 
 
309 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  63.55 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  58.94 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  58.23 
 
 
308 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  56.58 
 
 
310 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  56.58 
 
 
310 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  56.58 
 
 
310 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  56.13 
 
 
310 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.28 
 
 
304 aa  318  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 
313 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  60.32 
 
 
334 aa  308  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  52.4 
 
 
314 aa  298  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  49.51 
 
 
311 aa  288  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  50.31 
 
 
315 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  52.88 
 
 
299 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  53.82 
 
 
329 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  47.57 
 
 
300 aa  249  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  48.91 
 
 
319 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  45.05 
 
 
302 aa  242  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
306 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
303 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  44.55 
 
 
322 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  46.75 
 
 
305 aa  222  6e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  45.54 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.87 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 
305 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 
305 aa  215  8e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
314 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.94 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  42.99 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.94 
 
 
301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  44.94 
 
 
301 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.24 
 
 
304 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.22 
 
 
322 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  43.46 
 
 
322 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.62 
 
 
283 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.34 
 
 
331 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.47 
 
 
308 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
299 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
301 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.79 
 
 
331 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
302 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  40.08 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.45 
 
 
254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
237 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
301 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
310 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
301 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
337 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  52.75 
 
 
297 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.69 
 
 
310 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
353 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.35 
 
 
321 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  40.13 
 
 
282 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
317 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.08 
 
 
284 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.63 
 
 
332 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40.06 
 
 
326 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  41.61 
 
 
323 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.48 
 
 
286 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.13 
 
 
319 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 
332 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
330 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.75 
 
 
312 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.4 
 
 
319 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.98 
 
 
295 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  49.28 
 
 
321 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 
324 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.34 
 
 
294 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.72 
 
 
313 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 
280 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  39.56 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.87 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.22 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.97 
 
 
741 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  36.48 
 
 
303 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.98 
 
 
300 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  39.94 
 
 
324 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
321 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  38.73 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.74 
 
 
316 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.18 
 
 
324 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 
323 aa  179  7e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40 
 
 
319 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  39.23 
 
 
340 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.39 
 
 
342 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>