More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2919 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  100 
 
 		 334 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.07 
 
 		 304 aa  350  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  63.28 
 
 		 309 aa  349  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  62.83 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  60.6 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  60.32 
 
 		 313 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  57.52 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  60.33 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.34 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  59.21 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  61.67 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  59.44 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  57.1 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  62.34 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  55.82 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  55.82 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  53.47 
 
 		 311 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  53.44 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  55.48 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  53.14 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  53.92 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  53.14 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  56.16 
 
 		 313 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  52.85 
 
 		 319 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  50 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  49.66 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  46.49 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.72 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.83 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.2 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.87 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.86 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.33 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  42.3 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.81 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.88 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  38.24 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.86 
 
 		 310 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.25 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  44.86 
 
 		 254 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.12 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  43.97 
 
 		 741 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.76 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  45.25 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.67 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  44.87 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.57 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  43.73 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.12 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  50 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13320  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.72 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  43.39 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  37.66 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  45.93 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  45.37 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.58 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  47.11 
 
 		 756 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  48.44 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  48.37 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.82 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  47 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  37.3 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  40.44 
 
 		 304 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  40.47 
 
 		 241 aa  176  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  39.31 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.8 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.84 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.31 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>