More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3573 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  100 
 
 		 326 aa  648    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  42.09 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  42.14 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.74 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  42.62 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  43.14 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.47 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.72 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.36 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.47 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  44.74 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  40.72 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  42.24 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  41.61 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  45.37 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.84 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.22 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  41.84 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  42.53 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  42.47 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.42 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  40.82 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 237 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.92 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  38.71 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.03 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.02 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  40.27 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40 
 
 		 741 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.54 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  46.05 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.69 
 
 		 301 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.14 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.91 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.62 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  38.85 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  38.54 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.48 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  36.31 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  36.62 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.88 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  41.56 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.24 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  35.9 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  38.36 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  38.05 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.11 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  38.01 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  36.88 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.46 
 
 		 312 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.23 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  37.42 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  38.18 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  38.24 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.08 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  38.24 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.24 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.43 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.64 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  36.19 
 
 		 326 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  39.4 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  36.05 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.97 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  36.67 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>