More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2080 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  100 
 
 
388 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  69.67 
 
 
374 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  69.49 
 
 
308 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  66.55 
 
 
302 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  58.6 
 
 
338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  66.09 
 
 
312 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  60 
 
 
309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  62.12 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  66.21 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  62.37 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  64.31 
 
 
309 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  60.75 
 
 
310 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  60.75 
 
 
310 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.56 
 
 
308 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  60.41 
 
 
310 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  60.07 
 
 
310 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  62.12 
 
 
313 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  60.59 
 
 
313 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  58.33 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  55.48 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.89 
 
 
304 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  59.44 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  52.6 
 
 
299 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
306 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  48.43 
 
 
311 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  54.64 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  48.25 
 
 
300 aa  242  7e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
302 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  51.34 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
303 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
299 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  47.18 
 
 
302 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  46.96 
 
 
322 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 
305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
331 aa  217  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  45.61 
 
 
322 aa  216  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 
305 aa  215  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  45.26 
 
 
322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  43.54 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  38.05 
 
 
308 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.94 
 
 
331 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  45.14 
 
 
305 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
314 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  44.83 
 
 
330 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  44.06 
 
 
285 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.21 
 
 
305 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.88 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
314 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.96 
 
 
322 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.06 
 
 
286 aa  196  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.75 
 
 
310 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
301 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
301 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 
280 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.85 
 
 
304 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.02 
 
 
284 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.25 
 
 
313 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.52 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  44.22 
 
 
254 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  41.99 
 
 
302 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
301 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.66 
 
 
319 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  53.47 
 
 
237 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.55 
 
 
295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  43.54 
 
 
741 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  45.62 
 
 
282 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  43.72 
 
 
256 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
302 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  38.51 
 
 
353 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  44.03 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
301 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.44 
 
 
290 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
317 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35 
 
 
283 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
330 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  39.94 
 
 
309 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  42.21 
 
 
319 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
319 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
303 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.24 
 
 
324 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
319 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  46.73 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  38.98 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.67 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.2 
 
 
337 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  46.57 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  38.21 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.76 
 
 
294 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.45 
 
 
308 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  42.61 
 
 
290 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.64 
 
 
326 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  41.99 
 
 
312 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  44.91 
 
 
324 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 
313 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  39.3 
 
 
247 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  35.78 
 
 
343 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13320  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.57 
 
 
241 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  38.59 
 
 
300 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>