More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 304 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  60.86 
 
 		 311 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  66.24 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  61.24 
 
 		 308 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  62.71 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  58.96 
 
 		 312 aa  335  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  63.07 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  57.14 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.43 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  57.1 
 
 		 302 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  56.63 
 
 		 313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 338 aa  312  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  54.37 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  54.82 
 
 		 309 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  58.47 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  54.1 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  54.1 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  53.77 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  57.19 
 
 		 319 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  54.37 
 
 		 315 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  53.92 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  54.25 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  52.81 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  57.89 
 
 		 388 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  58.56 
 
 		 374 aa  295  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 303 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.05 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  42.16 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.02 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.63 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  43.48 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  40.8 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.2 
 
 		 321 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.13 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  40.4 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.87 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  41.69 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  53.49 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.88 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13320  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.48 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.93 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.75 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.29 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  39.4 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.51 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.26 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.5 
 
 		 347 aa  195  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  41.86 
 
 		 741 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.03 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  38.56 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  37.92 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  38.14 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.76 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  38.44 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  37.84 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  48.34 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.43 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.11 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.55 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.33 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  47.73 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  45.37 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.41 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 330 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  46.85 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  46.12 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  40.19 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.8 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.49 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  38.68 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.79 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.54 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  37.97 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  48.18 
 
 		 756 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  32.49 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.06 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  44.04 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>