More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3694 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  100 
 
 		 756 aa  1476    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  44.37 
 
 		 741 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  59.04 
 
 		 308 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  58.36 
 
 		 303 aa  317  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  54.61 
 
 		 301 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  53.26 
 
 		 300 aa  291  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6085  ABC transporter related  49.83 
 
 		 312 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  44.77 
 
 		 319 aa  239  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.33 
 
 		 304 aa  217  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.51 
 
 		 305 aa  210  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.18 
 
 		 301 aa  208  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.92 
 
 		 305 aa  207  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  48.43 
 
 		 310 aa  206  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.59 
 
 		 305 aa  207  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  42.11 
 
 		 312 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 		 305 aa  203  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 311 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  38.56 
 
 		 308 aa  198  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.88 
 
 		 322 aa  197  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  43.05 
 
 		 330 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 306 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.75 
 
 		 322 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  41.31 
 
 		 311 aa  191  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 		 310 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  39.47 
 
 		 308 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  44.24 
 
 		 256 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 314 aa  188  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  43.12 
 
 		 254 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.66 
 
 		 302 aa  187  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  39.02 
 
 		 323 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.99 
 
 		 339 aa  187  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  39.02 
 
 		 323 aa  187  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  42.15 
 
 		 295 aa  186  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  40.59 
 
 		 284 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  41.5 
 
 		 312 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  37.3 
 
 		 308 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  37.3 
 
 		 308 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 322 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  43.1 
 
 		 299 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  41.14 
 
 		 301 aa  184  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  38.74 
 
 		 318 aa  184  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  37.3 
 
 		 308 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39 
 
 		 303 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  47.37 
 
 		 263 aa  183  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 308 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.18 
 
 		 304 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 285 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  36.99 
 
 		 308 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 		 325 aa  182  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  36.19 
 
 		 308 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  37.22 
 
 		 315 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.42 
 
 		 310 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  36.99 
 
 		 308 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 311 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  39.63 
 
 		 283 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  43.21 
 
 		 311 aa  181  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 301 aa  181  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.08 
 
 		 330 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 323 aa  180  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  40.51 
 
 		 326 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 		 330 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  35.11 
 
 		 327 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  43.04 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  43.04 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  40.06 
 
 		 331 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 317 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 		 312 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 299 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.17 
 
 		 335 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 		 312 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 312 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 310 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 312 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 		 312 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  35.47 
 
 		 315 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 		 312 aa  178  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.51 
 
 		 284 aa  178  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 312 aa  178  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 312 aa  178  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  38.01 
 
 		 312 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.58 
 
 		 322 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  39.46 
 
 		 324 aa  177  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.44 
 
 		 316 aa  177  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 312 aa  177  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  36.42 
 
 		 310 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 237 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 300 aa  177  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 301 aa  177  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 319 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 312 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  39.73 
 
 		 282 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  35.18 
 
 		 319 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  41.75 
 
 		 247 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.39 
 
 		 290 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  45.54 
 
 		 319 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 		 309 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  46.58 
 
 		 322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 242 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  43.05 
 
 		 316 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>