More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4747 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  59.45 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  57.6 
 
 		 306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  58.45 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  56.36 
 
 		 302 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 299 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  53.7 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  56.13 
 
 		 322 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  54.79 
 
 		 302 aa  235  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 323 aa  232  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  54.71 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  52.34 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  53.12 
 
 		 330 aa  222  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  51.15 
 
 		 304 aa  222  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  42.74 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  48.92 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 308 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 305 aa  206  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  52.4 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 301 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  47.21 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  44.64 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 313 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  46.26 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  49.77 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  45.81 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.4 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 300 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  46.26 
 
 		 326 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  43.83 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  49.08 
 
 		 314 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  47.19 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  53.47 
 
 		 388 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  52.71 
 
 		 374 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  45.06 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.4 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  44.89 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 301 aa  188  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 302 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  48.36 
 
 		 315 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  45.98 
 
 		 305 aa  188  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  50.94 
 
 		 282 aa  187  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  46.85 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.25 
 
 		 284 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  48.84 
 
 		 308 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 280 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  48.84 
 
 		 741 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  49.77 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  46.85 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  46.9 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  48.17 
 
 		 756 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 342 aa  181  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 310 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  46.98 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 301 aa  177  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  45.67 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 317 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  46.54 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.98 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  42.22 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  50 
 
 		 297 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  48.17 
 
 		 319 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  45 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 294 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 314 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  47.95 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 300 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  47.37 
 
 		 319 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  46.86 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  46.86 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  46.86 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 300 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 		 300 aa  171  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 309 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  49.53 
 
 		 334 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  42.92 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  43.12 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  42.59 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 		 353 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 311 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  42.92 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  46.12 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>