More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0704 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  76.71 
 
 
254 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.95 
 
 
319 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
301 aa  234  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  44.74 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  45.39 
 
 
305 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
305 aa  231  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  44.37 
 
 
283 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  52.34 
 
 
304 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
306 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  46.06 
 
 
302 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  41.5 
 
 
308 aa  225  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
310 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  43.06 
 
 
301 aa  219  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  43.06 
 
 
305 aa  218  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  49.32 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  42.8 
 
 
256 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
285 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.79 
 
 
300 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 
294 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
299 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40 
 
 
300 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  43.64 
 
 
322 aa  208  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  47.11 
 
 
295 aa  208  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.5 
 
 
322 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
302 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
301 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  44.44 
 
 
290 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  43.95 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40.5 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  45.33 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.43 
 
 
279 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  46.8 
 
 
312 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  42.47 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  41.67 
 
 
330 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.47 
 
 
328 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
308 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  44 
 
 
756 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 
293 aa  195  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  35.67 
 
 
311 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  43.3 
 
 
741 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  45.91 
 
 
339 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  44.14 
 
 
319 aa  193  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
301 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
246 aa  193  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  41.31 
 
 
312 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
280 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.44 
 
 
329 aa  191  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
338 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 
320 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  43.06 
 
 
276 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
302 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 
339 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
314 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
314 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
319 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  41.2 
 
 
309 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 
328 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  41.67 
 
 
315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
331 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 
330 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 
343 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
301 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  47.25 
 
 
290 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  43.18 
 
 
314 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  39.29 
 
 
590 aa  188  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  42.33 
 
 
284 aa  188  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
299 aa  188  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  43.44 
 
 
247 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  39 
 
 
262 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  44.84 
 
 
317 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  43.89 
 
 
328 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.24 
 
 
319 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.34 
 
 
321 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  39.92 
 
 
241 aa  186  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  38.41 
 
 
279 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
310 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.06 
 
 
374 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.25 
 
 
309 aa  186  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  37.69 
 
 
248 aa  185  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 
327 aa  185  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  42.15 
 
 
327 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  37.63 
 
 
290 aa  185  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  38.28 
 
 
590 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 
309 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  43.72 
 
 
388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  41.78 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.32 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  40.24 
 
 
580 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  42.86 
 
 
330 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.18 
 
 
317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.49 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 
313 aa  183  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.44 
 
 
310 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.38 
 
 
308 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>