More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3547 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  100 
 
 
290 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  61.36 
 
 
299 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  59.8 
 
 
302 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  59.12 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
303 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  59.4 
 
 
314 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  55.41 
 
 
322 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  56.04 
 
 
302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  55.18 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  53.31 
 
 
323 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  54.29 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  48.49 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  54.46 
 
 
237 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  44.22 
 
 
319 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.33 
 
 
304 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.17 
 
 
301 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  41.5 
 
 
305 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 
305 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  42.38 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  42.53 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.3 
 
 
308 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
310 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  46.98 
 
 
254 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  42.86 
 
 
300 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.62 
 
 
310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  47.25 
 
 
256 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  38.7 
 
 
283 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
293 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  39.56 
 
 
314 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  44.01 
 
 
319 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.29 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  36.67 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  42.24 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.95 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
300 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  42.42 
 
 
741 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  44.33 
 
 
247 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
300 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  41.67 
 
 
308 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  45.58 
 
 
303 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.33 
 
 
300 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
297 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  40.66 
 
 
319 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  40.07 
 
 
315 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
300 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 
299 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  40.2 
 
 
308 aa  175  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.82 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  41.78 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.52 
 
 
328 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  43.22 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  37.88 
 
 
303 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  42.61 
 
 
388 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  40.67 
 
 
308 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.14 
 
 
295 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  40.86 
 
 
299 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  43.29 
 
 
324 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  35.17 
 
 
300 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
342 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  39.53 
 
 
307 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  42.05 
 
 
338 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.48 
 
 
313 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.42 
 
 
324 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  43.66 
 
 
374 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
302 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  36.19 
 
 
340 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
301 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  39.39 
 
 
299 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.03 
 
 
411 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.01 
 
 
343 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
301 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  43.75 
 
 
920 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.48 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.79 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.95 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  36.45 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  40 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  37.95 
 
 
320 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  37.97 
 
 
320 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  37.95 
 
 
303 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  37.84 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  36.1 
 
 
326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  37.75 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 
322 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.17 
 
 
326 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.84 
 
 
373 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  37.06 
 
 
282 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
310 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38 
 
 
310 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>