More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1267 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  100 
 
 
303 aa  597  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  57.54 
 
 
303 aa  318  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  58.27 
 
 
305 aa  309  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  55.09 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  56.74 
 
 
293 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.86 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  53.1 
 
 
325 aa  278  9e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 
300 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
300 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 
300 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  47.9 
 
 
299 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
300 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
300 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  42.12 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
300 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  40.07 
 
 
300 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  43.54 
 
 
298 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  39.78 
 
 
300 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  44.06 
 
 
295 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  39.02 
 
 
329 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
303 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.41 
 
 
305 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.06 
 
 
301 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  41.64 
 
 
300 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  42.95 
 
 
300 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
314 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  37.92 
 
 
326 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  42.47 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  43.01 
 
 
322 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.18 
 
 
295 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  39.74 
 
 
309 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  39.22 
 
 
343 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.71 
 
 
304 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  37.11 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  39.74 
 
 
306 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
308 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.11 
 
 
308 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
314 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  39.23 
 
 
339 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  37.46 
 
 
312 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.25 
 
 
316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
305 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.06 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
305 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
299 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  39.86 
 
 
284 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.31 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  36.88 
 
 
305 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 
279 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.59 
 
 
317 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.46 
 
 
339 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  38.05 
 
 
297 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.46 
 
 
339 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.89 
 
 
310 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.18 
 
 
326 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
334 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.15 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  37.98 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40.26 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  44.3 
 
 
250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.54 
 
 
741 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.44 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
332 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 
302 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.67 
 
 
316 aa  178  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  35.81 
 
 
316 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.22 
 
 
311 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  38.08 
 
 
305 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  41.26 
 
 
311 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  38.08 
 
 
305 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  44.4 
 
 
337 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  37.06 
 
 
339 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 
308 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.26 
 
 
312 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
335 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  42.37 
 
 
340 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.93 
 
 
322 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  38.82 
 
 
319 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.27 
 
 
316 aa  175  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
313 aa  175  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.63 
 
 
317 aa  175  8e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.57 
 
 
317 aa  175  9e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  39.38 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  40.91 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  38.82 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.8 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.2 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  38.82 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  36.07 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.82 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.25 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>