More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  56.9 
 
 		 321 aa  301  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.63 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  49.84 
 
 		 319 aa  255  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47.39 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  43.32 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  47.33 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.85 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.45 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.36 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  49.06 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  46.36 
 
 		 276 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  45.22 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  37.21 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.12 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.95 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.6 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  46.89 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  43.52 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  40.79 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  43.41 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  45.59 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  41.12 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  49.52 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.15 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  38.13 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  45.22 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.15 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  39.14 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  45.59 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  35.67 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  38.46 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  40.42 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  37.1 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  41.67 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  41.05 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  35 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  38.41 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  39.51 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  39 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  33.55 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  37.3 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  38.44 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  37.92 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  40.09 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  41.01 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.7 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  39.81 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  41.31 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.89 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.67 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  40.55 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.27 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  37.3 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  39.01 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  41.28 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  37.5 
 
 		 256 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  36.3 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.05 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 253 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  38.96 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>