More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4919 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  100 
 
 
302 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  65.67 
 
 
306 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  64.12 
 
 
302 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  63.58 
 
 
299 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  57.43 
 
 
322 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  57.62 
 
 
303 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  62.08 
 
 
314 aa  330  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  54.93 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  53.5 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  56.04 
 
 
290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  54.55 
 
 
322 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  55.33 
 
 
323 aa  285  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  56.48 
 
 
256 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  43.56 
 
 
305 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
305 aa  251  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
305 aa  250  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  46.05 
 
 
308 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  49.49 
 
 
388 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  46.71 
 
 
302 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  45.9 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  54.79 
 
 
237 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  45.28 
 
 
309 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  45.71 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  48.26 
 
 
374 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.67 
 
 
304 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  45.36 
 
 
308 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  44.85 
 
 
310 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  44.85 
 
 
310 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  44.85 
 
 
310 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  44.52 
 
 
309 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
310 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
338 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  45.21 
 
 
319 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  44.14 
 
 
247 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.29 
 
 
308 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.8 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  46.08 
 
 
256 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  43 
 
 
319 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  41.61 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  43.42 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.26 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 
313 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  49.27 
 
 
263 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.44 
 
 
310 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.53 
 
 
304 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  42.07 
 
 
319 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
314 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.41 
 
 
328 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.24 
 
 
339 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  45 
 
 
282 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  46.23 
 
 
302 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  41.16 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
293 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.39 
 
 
326 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  48.84 
 
 
300 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  43.75 
 
 
290 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  34.98 
 
 
295 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  37.7 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.99 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.56 
 
 
283 aa  195  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  43.61 
 
 
334 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 
294 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
280 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
300 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.41 
 
 
310 aa  191  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 
300 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 
328 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.38 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  34.83 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 
300 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 
300 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  44.3 
 
 
284 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.74 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.69 
 
 
741 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
302 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
301 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.68 
 
 
328 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.77 
 
 
305 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  42.92 
 
 
276 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.96 
 
 
327 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.92 
 
 
343 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  38.89 
 
 
340 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
300 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 
300 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  35.37 
 
 
312 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  38.78 
 
 
320 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.41 
 
 
310 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.44 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.14 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>