More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1066 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 		 294 aa  288  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  45.03 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  44.37 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  43.85 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.43 
 
 		 319 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  42.95 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  41.02 
 
 		 283 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  42.02 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.8 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  42.47 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  42.12 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  41.95 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.13 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.27 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  44.86 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.66 
 
 		 312 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  40.2 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.06 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  36.16 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  36.79 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  37.07 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  35.85 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.2 
 
 		 741 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  35.85 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  37.91 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  44.89 
 
 		 256 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  37.58 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  37.16 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  37.58 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  34.5 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  37.58 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  37.58 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  37.58 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  37.58 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  34.5 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  37.8 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  34.5 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  36.81 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.42 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.21 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  36.69 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.93 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  34.5 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  34.5 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.55 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  37.09 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.34 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  38.24 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.01 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  38.56 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  34.98 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.21 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  34.7 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  37.46 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  34.64 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.31 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  36.36 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  35.67 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  37.26 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  37.58 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  36.72 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  37.54 
 
 		 756 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  36.96 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.52 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.04 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  36.62 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  33.78 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  35.85 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>