More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3573 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  100 
 
 		 313 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  87.9 
 
 		 314 aa  567  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  77.96 
 
 		 307 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  78.96 
 
 		 327 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  77.42 
 
 		 323 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  76.77 
 
 		 312 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  75.32 
 
 		 315 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  59.87 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  56.96 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  56.01 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  55.31 
 
 		 304 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  55.31 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  56.95 
 
 		 304 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  56.95 
 
 		 304 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  56.35 
 
 		 303 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  56.29 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  54.75 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  56.62 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  56.86 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  56.86 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  56.86 
 
 		 306 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  56.86 
 
 		 304 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  56.86 
 
 		 304 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  56.86 
 
 		 304 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  55.63 
 
 		 304 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  56.86 
 
 		 304 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  55.96 
 
 		 304 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  55.96 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  53.7 
 
 		 304 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  55.81 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  54.9 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  55.05 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  52.43 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  52.61 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  51.45 
 
 		 304 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  55.05 
 
 		 325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  50.16 
 
 		 302 aa  305  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  49.03 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  51.17 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  49.19 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  46.93 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  49.5 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  48.05 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  45.83 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  45.83 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  45.34 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 312 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  45.95 
 
 		 303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  45.83 
 
 		 310 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 311 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  46.05 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  43.87 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  45.83 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  44.7 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.69 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  43.37 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  45.05 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  47.37 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  43.45 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  43.18 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  43.37 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  42.77 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  42.31 
 
 		 311 aa  245  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  43.9 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  42.33 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  42.33 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  39.24 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.06 
 
 		 312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.88 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.32 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  39.94 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.33 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.82 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.86 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.71 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.29 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.69 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.08 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.22 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.49 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  38.54 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  37.62 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.94 
 
 		 328 aa  191  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.71 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.96 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  36.89 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  35.38 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>