More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2121 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  100 
 
 
315 aa  636    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  53.07 
 
 
321 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  53.65 
 
 
322 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  52.75 
 
 
320 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  53.07 
 
 
320 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  53.51 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  52.81 
 
 
304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  55.14 
 
 
304 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  52.81 
 
 
304 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  52.81 
 
 
304 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  53.77 
 
 
304 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  52 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  50.96 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  51.99 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  55.31 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  52.15 
 
 
304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  50 
 
 
314 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  51.82 
 
 
373 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  52.43 
 
 
351 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  52.43 
 
 
351 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  55.21 
 
 
306 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  55.21 
 
 
304 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  55.21 
 
 
304 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  55.21 
 
 
304 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  55.21 
 
 
304 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  52.75 
 
 
310 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  50.48 
 
 
344 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  49.67 
 
 
307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  48.23 
 
 
314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  53.7 
 
 
311 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  50 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  51.66 
 
 
312 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  52.32 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  47.74 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  50.32 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  48.23 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  51.9 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  52.4 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  49.84 
 
 
326 aa  302  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  50.32 
 
 
325 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  48.01 
 
 
305 aa  299  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  53.42 
 
 
304 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  51.16 
 
 
306 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  52.67 
 
 
310 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  49.5 
 
 
345 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  50.84 
 
 
293 aa  296  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  51.32 
 
 
301 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  50.48 
 
 
328 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  49.67 
 
 
309 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  49.67 
 
 
309 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  49.5 
 
 
310 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  46.77 
 
 
323 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  47.85 
 
 
304 aa  288  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  48.22 
 
 
339 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  50.48 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  46.18 
 
 
355 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  49.03 
 
 
313 aa  285  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
311 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  48.49 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  48.77 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  47.49 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.01 
 
 
317 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  46.26 
 
 
308 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  50.8 
 
 
317 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  48.01 
 
 
303 aa  273  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  46.82 
 
 
305 aa  271  9e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  46.2 
 
 
307 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  44.74 
 
 
300 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  42.86 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.14 
 
 
320 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  43.28 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  42.19 
 
 
305 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  42.07 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.78 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  42.21 
 
 
304 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.26 
 
 
308 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
305 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.35 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.42 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.44 
 
 
319 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.39 
 
 
312 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
312 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  41.32 
 
 
315 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  37.54 
 
 
327 aa  208  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
279 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.09 
 
 
279 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.01 
 
 
335 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
312 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
334 aa  206  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
345 aa  205  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>